剧情体验：
倒幕派：主张推翻德川幕府，建立新政权。剧情围绕着刺杀保守派人物、破坏幕府势力展开，能与坂本龙马、桂小五郎等激进改革派角色并肩作战，体验明治维新路线，推动日本现代化进程，引入西方技术与思想。如果你喜欢革命、变革以及高自由度的战斗，追求剧情的紧张刺激和颠覆性，倒幕派是不错的选择。
佐幕派：支持德川幕府，试图通过内部改革延续传统统治。任务以镇压倒幕势力、维护社会稳定为主，涉及传统武士道的忠诚与牺牲主题。选择佐幕派会与德川庆喜、近藤勇等保守派角色互动频繁，适合喜爱传统武士精神、追求剧情厚重感和想体验权谋斗争的玩家，比如参与《日美友好通商条约》签订等历史事件。
战斗风格：
倒幕派：任务多为刺杀、策划起义等，需要利用火枪、滑翔翼等机制，通过潜行方式完成任务，技能侧重于暗杀，战斗风格更注重策略与隐蔽，适合喜欢暗中行动、以巧取胜，以及偏好远程攻击和科技流的玩家。
佐幕派：主要任务是正面冲突上的镇压，包括 boss 车轮战、据点镇压等，战斗风格强调正面交锋和强大防御，在激烈的战斗中提升实力，适合喜欢硬核战斗、近战攻击，以及偏好传统武士刀战斗方式的玩家。
角色因缘：游戏中与特定角色的好感度会影响你的选择。如果你与坂本龙马、桂小五郎等倒幕派角色建立了高因缘等级，选择倒幕派可触发专属剧情和奖励；若与德川庆喜、近藤勇等佐幕派角色因缘深厚，则选择佐幕派能获得相应的专属内容。
成就奖励：倒幕派有 “维新之岚” 成就，要求无伤通关 3 次刺杀关卡；佐幕派有 “幕府之盾” 成就，需完成 30 次镇压任务。如果玩家想要达成特定成就，可根据成就要求来选择派系。
由于游戏有 “留魂录” 系统，玩家可回溯关键节点，触发隐藏支线任务。所以也可以先随意选择一个派系进行体验，然后在二周目时选择另一个派系，以补全不同视角的剧情。